Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KNOP1Q1ED39 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms