Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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RPE65Q16518 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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