Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms