Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TCEA2Q15560 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms