Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF13Q15543 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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TAF13Q15543 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TAF13Q15543 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TAF13Q15543 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TAF13Q15543 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TAF13Q15543 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms