Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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