Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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