Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERV3-1Q14264 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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