Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE3BQ13370 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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