Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PTGDRQ13258 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTGDRQ13258 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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PTGDRQ13258 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
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PTGDRQ13258 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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PTGDRQ13258 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PTGDRQ13258 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PTGDRQ13258 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PTGDRQ13258 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PTGDRQ13258 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGDRQ13258 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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