Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEMA3BQ13214 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms