Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms