Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms