Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.33■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms