Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF17Q02223 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms