Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2B2Q01814 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms