Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN2P57739 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms