Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AQP4P55087 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AQP4P55087 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AQP4P55087 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms