Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SMARCA4P51532 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMARCA4P51532 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms