Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFNP31947 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFNP31947 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SFNP31947 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SFNP31947 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SFNP31947 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SFNP31947 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SFNP31947 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SFNP31947 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFNP31947 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms