Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLIP1P30622 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms