Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC5P28715 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC5P28715 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms