Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BCL3P20749 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BCL3P20749 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BCL3P20749 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BCL3P20749 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BCL3P20749 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BCL3P20749 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BCL3P20749 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BCL3P20749 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BCL3P20749 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BCL3P20749 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms