Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms