Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNA2P01563 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNA2P01563 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms