Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP4K4O95819 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms