Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCNKO75909 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNKO75909 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNKO75909 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCNKO75909 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNKO75909 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNKO75909 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms