Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME2P1O60361 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms