Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DFFAO00273 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DFFAO00273 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DFFAO00273 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DFFAO00273 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DFFAO00273 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DFFAO00273 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DFFAO00273 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DFFAO00273 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DFFAO00273 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DFFAO00273 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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