Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB9F8W1W9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms