Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms