Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
A8MVJ9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A8MVJ9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A8MVJ9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms