Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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