Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HELTA6NFD8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HELTA6NFD8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HELTA6NFD8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HELTA6NFD8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HELTA6NFD8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HELTA6NFD8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HELTA6NFD8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HELTA6NFD8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HELTA6NFD8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HELTA6NFD8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HELTA6NFD8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms