Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms