Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LEMD3Q9Y2U8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms