Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM2AQ9Y2K7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM2AQ9Y2K7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms