Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMPRSS11EQ9UL52 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS11EQ9UL52 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms