Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CROTQ9UKG9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CROTQ9UKG9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms