Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RPUSD1Q9UJJ7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPUSD1Q9UJJ7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms