Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20BQ9P0W2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms