Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms