Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP8A2Q9NTI2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms