Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCM1Q9NP62 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms