Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPF2Q9HAU5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPF2Q9HAU5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms