Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LNPKQ9C0E8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LNPKQ9C0E8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms