Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSD3Q9BZ95 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms