Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTKNQ9BST9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTKNQ9BST9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms