Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NICN1Q9BSH3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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