Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C2orf88Q9BSF0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C2orf88Q9BSF0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms